WMS-Onlineは日常の倉庫業務の正確性を保全する様々な機能を提供するだけではなく、荷主企業の庫内業務改善や物流改革を支援すべく高度な機能が標準で実装されています。　　　　　　　　

予め出荷が予定されている商品には入庫作業をスキップして出荷作業へ移れる機能です。短納期の商品に対して起こる"運用で逃げる"（システムと庫内作業実態の乖離を埋める）ことをなくします。

出荷時に必要な部品をピッキングして完成品を作成し出荷する機能です。完成品の作成を最終段階に行うことによって余剰在庫を低減を支援します。

商品が入荷された際に荷姿を変えて在庫品として保管できる機能です。在庫をバラ（最小管理単位）で保管することで余剰在庫の低減を支援します。

在庫品に対してパレート分析を行い分類に応じて商品の格納をコントロールできる機能です。高回転率の商品の保管場所を集約することによって、ピッキング時の動線を改善しピッキング効率を支援します。

いわゆるVMI（Vendor Managed Inventory）機能です、保管商品に指定されている補充レベル（発注点）まで在庫が下がるとシステムは自動で補充元倉庫に対し補充指示を行います。

小売店の店頭に並べられた商品に対し補充レベルの設定し、POS端末などとインターフェースをとることによって自動で店頭在庫を補充する機能です。